Система менеджмента качества - является частью системы управления организации. Одной из целей системы качества является - соответствие результатов процессов компании потребностям потребителя, организации и общества. Компания ежегодно подтверждает право обладать сертификатом соответствия 

Компания в 2017г. впервые получила сертификат соответствия на стандарт СТ РК ИСО 14001-2006 «Системы экологического менеджмента. Требования и руководство к применению». В 2020г. подтвердила свое соответствие данному стандарту.
Общая направленность требований данного стандарта является – поддержка  мероприятий по охране окружающей среды и предотвращению ее загрязнения в балансе с удовлетворением социально-экономических потребностей при фармацевтической деятельности.

OHSAS 18001 － один из международных стандартов, который содержит требования и указания, связанные с внедрением системы менеджмента промбезопасности и охраны труда.

В 2017г. компанией  получен сертификат соответствия на стандарт ГОСТ ISO 22000-2019 «Система менеджмента безопасности пищевой продукции. Требования к организациям, участвующим в цепи создания пищевой продукции». В 2020г. получено подтверждение соответствия данному стандарту.
Системы менеджмента безопасности пищевой продукции - стратегическое решение, которое улучшает общую результативность работы Компании в области обеспечения пищевой безопасности.

Все филиалы КФК "Медсервис Плюс" работают по стандарту надлежащей дистрибьюторской практики.
Уровень качества дистрибьюции поддерживается и постоянно улучшается. В управлении качеством услуг и обслуживания потребителей участвуют все уровни персонала компании под руководством директора по качеству и контролем отдела обеспечения качества. Действия руководства Компании, филиалов и персонала направлены на планомерное улучшение системы качества. КФК "Медсервис Плюс" прошла более 20 успешных государственных инспекций на соответствие требованиям надлежащей дистрибьюторской практики. Получены сертификаты соответствия, выданные Комитетом медицинского и фармацевтического контроля МЗ РК.

В 2021г. производственная площадка Компании получила сертификат на соответствие требованиям стандарта надлежащей производственной практики. На заводе соблюдаются высокие требования к организации производства и контроля качества лекарственных средств.

Активно развивается розничная сеть Компании. Деятельность аптек Компании осуществляется на основании требований надлежащей аптечной практики.

Компания в 2021г. впервые получила сертификат соответствие на стандарт ГОСТ Р ИСО/МЭК 27001-2006 «Информационная технология. Методы и средства обеспечения безопасности. Система менеджмента информационной безопасности».
Он является международный стандартом, который устанавливает требования к системе менеджмента информационной безопасности для организации защиты информационных ресурсов.
Компания внедрила требования системы менеджмента информационной безопасности, которая основана на работе с бизнес-рисками при создании, внедрении, функционировании, мониторинге, анализе, поддержке и улучшении информационной безопасности.